Vyrų lytinių organų sistemą sudaro tiek išorinės, tiek vidinės dalys. Išoriniai vyrų lytiniai organai apima varpą, šlaplę ir kapšelį. Vidiniai vyriški lytiniai organai apima sėklinę pūslelę, sėklides, vazos defektus, epididimą, prostatą, bulbourethralinę liauką ir ejakuliacijos kanalą.
Varpos yra pagrindinė išorinių vyrų lytinių organų dalis, atliekanti ir lytines, ir kūno funkcijas. Jis sugeba lyties metu išsiveržti spermą (kurioje yra spermos) ir išlaisvinti šlapimą. Šlaplė perneša šlapimą iš šlapimo pūslės, iš vyro kūno. Sperma taip pat keliauja per šlaplę.
Kiekvienas patinas turi du kapšelio maišelius, kuriuose yra tam tikros vidinių vyriškų lytinių organų dalys (epididimas, sėklidės ir apatinės spermatozoido virvelės). Sėklidės yra svarbiausia vidinių vyrų lytinių organų dalis, nes jos gamina ir kaupia spermą, taip pat vyro organizmą aprūpina hormonais, kurie kontroliuoja vyriškų savybių ir reprodukcinių organų vystymąsi.
Kiaušidės kaupia, subrandina ir perneša spermatozoidus tarp sėklidžių ir kraujagyslių, kurie spermatozoidus nukreipia link šlaplės. Sėklinės pūslelės yra greta šlaplės ir išskiria pienišką skystį, kuris galiausiai išleidžiamas per ejakuliacijos kanalą. Bulbourethralinės liaukos taip pat padeda išleisti spermą.
